1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
package com.yuanchu.mom.utils;
 
import cn.hutool.core.io.IORuntimeException;
import cn.hutool.http.HttpUtil;
import com.alibaba.fastjson.JSON;
import com.alibaba.fastjson.JSONArray;
import com.alibaba.fastjson.JSONObject;
import com.baomidou.mybatisplus.core.toolkit.ObjectUtils;
import com.yuanchu.mom.exception.ErrorException;
import com.yuanchu.mom.pojo.DataConfig;
import com.yuanchu.mom.pojo.Device;
 
import javax.script.ScriptEngine;
import javax.script.ScriptEngineManager;
import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
import java.math.BigDecimal;
import java.util.*;
import java.util.regex.Matcher;
import java.util.regex.Pattern;
import java.util.stream.Collectors;
 
public class DataAcquisition {
 
    private static final String HTTP = "http://";
 
    private static final String GETFILE = ":9527/lims/getFile"; // 获取文件接口
 
    private static final String MOVEFILE = ":9527/lims/moveFile"; // 文件移动地址
 
    private static final String splitIdentifier = "@-@"; // 自定义唯一标识分割符
 
    public static final String frequency = "frequency";
 
    /**
     * 数采入口
     *
     * @param dataConfig
     * @param device
     * @return
     */
    public static Map<String, String> dataAcquisitionEntrance(List<DataConfig> dataConfig, Device device, String entrustCode, String sampleCode, String ip) {
        /**
         * filePath 文件采集路径
         * fileExtension 文件后缀
         * entrustCode 委托编号
         * sampleCode 样品编号
         * mdbEntrustCode mdb文件需要:委托编号字段
         * mdbSampleCode mdb文件需要:样品编号字段
         */
        String http = HTTP + ip + GETFILE +
                "?filePath=" + device.getCollectUrl() +
                "&fileExtension=" + device.getFileType() +
                "&entrustCode=" + entrustCode +
                "&sampleCode=" + sampleCode +
                "&mdbEntrustCode=" + device.getMdbEntrustCode() +
                "&mdbSampleCode=" + device.getMdbSampleCode();
        String result = null;
        try {
            result = HttpUtil.get(http);
        } catch (IORuntimeException e) {
            throw new ErrorException("所在电脑未安装或未启动:LIMS文件采集器!");
        }
        JSONObject jsonObject = JSON.parseObject(result);
        if (Objects.equals(jsonObject.get("code"), 1)) {
            if (ObjectUtils.isEmpty(jsonObject.get("msg"))) {
                throw new ErrorException("未查询到数据,可能文件路径配置错误!");
            } else {
                System.out.println(jsonObject);
                throw new ErrorException("未知错误,请联系管理员!");
            }
        } else {
            String data = jsonObject.get("data").toString();
            // 考虑到一个检测项可能会存在多个数采配置,所以需要进行分组
            Map<String, List<DataConfig>> userMap = dataConfig.stream()
                    .peek(i -> i.setInsProductItem(
                            i.getInspectionItem().equals(i.getInspectionItemSubclass()) ? i.getInspectionItem() + "," : i.getInspectionItem() + "," + i.getInspectionItemSubclass()
                    ))
                    .collect(Collectors.groupingBy(DataConfig::getInsProductItem));
            Map<String, String> map;
            switch (device.getFileType()) {
                case ".docx":
                    map = analysisString(data, userMap);
                    break;
                case ".xlsx":
                    map = analysisList(data, userMap);
                    break;
                case ".txt":
                    map = analysisTxt(data, userMap);
                    break;
                case ".csv":
                    map = analysisList(data, userMap);
                    break;
                case ".mdb":
                    map = analysisMdb(data, userMap);
                    break;
                case ".db":
                    map = analysisDb(data, userMap);
                    break;
                case ".png":
                    map = readPngString(data, userMap);
                    break;
                default:
                    map = null;
                    break;
            }
            // 如果存在存储地址,则移动地址
            if (ObjectUtils.isNotEmpty(device.getStorageUrl())) {
                String s = HTTP + ip + MOVEFILE + "?startFilePath=" + device.getCollectUrl() + "&endFilePath=" + device.getStorageUrl() + "&fileType=" + device.getFileType();
                String storageUrlResult = HttpUtil.get(s);
                JSONObject storageUrlResultJson = JSON.parseObject(storageUrlResult);
            }
            return map;
        }
    }
 
    public static String createFrequency(String entrustCode, String sampleCode) {
        String key = frequency + ":" + entrustCode + ":" + sampleCode;
        boolean b = RedisUtil.hasKey(key);
        String frequencyValue;
        if (b) {
            long incr = RedisUtil.incr(key, 1);
            frequencyValue = String.valueOf(incr);
        } else {
            RedisUtil.set(key, 1);
            frequencyValue = "1";
        }
        return frequencyValue;
    }
 
    /**
     * 需要通过X,Y轴定位
     *
     * @param data
     * @param dataConfig
     * @return
     */
    private static Map<String, String> analysisDb(String data, Map<String, List<DataConfig>> dataConfig) {
        JSONObject jsonObject = JSON.parseObject(data);
        Map<String, String> map = new HashMap<>();
        if (jsonObject.isEmpty()) {
            return map;
        }
        JSONArray dataList = JSONArray.parseArray(jsonObject.get("data").toString());
        dataConfig.forEach((k, v) -> {
            List<Object> list = new ArrayList<>();
            for (int config = 0; config < v.size(); config++) {
                String referx = getRefer(v.get(config).getReferx());
                for (int i = 0; i < dataList.size(); i++) {
                    JSONObject jsonObject1 = JSON.parseObject(dataList.get(i).toString());
                    Object o = jsonObject1.get(referx);
                    if (ObjectUtils.isNotEmpty(o)) {
                        list.add(o);
                    }
                }
            }
            // 进行公式计算
            String resultValue = calculationFormula(list, v.get(0), k);
            map.put(k, resultValue);
        });
        return map;
    }
 
    /**
     * @param data
     * @param dataConfig
     * @return
     */
    private static Map<String, String> analysisMdb(String data, Map<String, List<DataConfig>> dataConfig) {
        JSONObject jsonObject = JSON.parseObject(data);
        Map<String, String> map = new HashMap<>();
        if (jsonObject.isEmpty()) {
            return map;
        }
        JSONArray dataList = JSONArray.parseArray(jsonObject.get("data").toString());
        dataConfig.forEach((k, v) -> {
            List<Object> list = new ArrayList<>();
            for (int config = 0; config < v.size(); config++) {
                String referx = getRefer(v.get(config).getReferx());
                for (int i = 0; i < dataList.size(); i++) {
                    JSONObject jsonObject1 = JSON.parseObject(dataList.get(i).toString());
                    Object o = jsonObject1.get(referx);
                    if (ObjectUtils.isNotEmpty(o)) {
                        list.add(o);
                    }
                }
            }
            // 进行公式计算
            String resultValue = calculationFormula(list, v.get(0), k);
            map.put(k, resultValue);
        });
        return map;
    }
 
    private static Pattern SPATTERN = Pattern.compile("([-+])?\\d+(\\.\\d+)?");
 
    /**
     * 只需X轴
     *
     * @param data       采集到的文件字符串
     * @param dataConfig 用户配置好的x,y轴定位数据与参照物
     * @return
     */
    private static Map<String, String> readPngString(String data, Map<String, List<DataConfig>> dataConfig) {
        Map<String, String> map = new HashMap<>();
        dataConfig.forEach((k, v) -> {
            List<Object> list = new ArrayList<>();
            for (int config = 0; config < v.size(); config++) {
                String referx = getRefer(v.get(config).getReferx());
                String result = null;
                // 通过\n将字符串分割为行
                String[] aColumnY = data.split("\n");
                List<String> list1 = new ArrayList<>();
                // 该循环得出用户配置的y轴
                for (int i = 0; i < aColumnY.length; i++) {
                    String addDataWithSpaces = referx.replaceAll("", " ");
                    int x = getXOrY(v.get(config).getX(), k, "X");
                    if (aColumnY[i].contains(addDataWithSpaces)) {
                        Matcher matcher = SPATTERN.matcher(aColumnY[i]);
                        while (matcher.find()) {
                            String group = matcher.group();
                            list1.add(group);
                        }
                    }
                    if (ObjectUtils.isNotEmpty(list1)) {
                        result = list1.get(x);
                    }
                }
                if (ObjectUtils.isNotEmpty(result)) {
                    list.add(result);
                }
            }
            // 进行公式计算
            String resultValue = calculationFormula(list, v.get(0), k);
            map.put(k, resultValue);
        });
        return map;
    }
 
    /**
     * 从文件中提取出来的文字,如果有公式,进行公式计算,否则取列表第一个值
     *
     * @param list       提取出的数字
     * @param dataConfig 存储公式的对象
     * @return
     */
    private static String calculationFormula(List<Object> list, DataConfig dataConfig, String insProductItem) {
        if (list.size() == 0) {
            return null;
        }
        // 如果不为空,进行公式计算
        if (ObjectUtils.isNotEmpty(dataConfig.getFormula())) {
            String formula = dataConfig.getFormula();
            //首先将list转换为bigdecmic
            List<BigDecimal> bigDecimalList = list.stream()
                    .map(obj -> {
                        return new BigDecimal((obj).toString());
                    }).collect(Collectors.toList());
            System.out.println(bigDecimalList);
 
            //将中文的(转换英文的())
            formula = formula.replace("(", "(")
                    .replace(")", ")")
                    .replace(",", ",");
            //然后提取公式
            String strs = formula.substring(0,formula.indexOf("("));
            String upperStr = strs.toUpperCase();
            if (upperStr.matches(".*\\d.*")){
                upperStr="";
            }
            System.out.println(upperStr);
            //然后获取最外面括号里面的值,再根据","分割
            int start = formula.indexOf("(");
            int end = -1;
            int a = 0;
            for (int i = start; i < formula.length(); i++) {
                char c = formula.charAt(i);
                if (c == '(') {
                    a++;
                } else if (c == ')') {
                    a--;
                    if (a == 0) {
                        end = i;
                    }
                }
            }
            if (start == -1 || end == -1) {
                throw new ErrorException("公式括号不匹配: " + formula);
            }
 
            String argumentsStr = formula.substring(start + 1, end);
            List<String> arguments = new ArrayList<>();
            int bracketCount = 0;
            StringBuilder currentArgument = new StringBuilder();
            for (char c : argumentsStr.toCharArray()) {
                if (c == ',' && bracketCount == 0) {
                    arguments.add(currentArgument.toString());
                    currentArgument.setLength(0);
                } else {
                    if (c == '(') bracketCount++;
                    if (c == ')') bracketCount--;
                    currentArgument.append(c);
                }
            }
            arguments.add(currentArgument.toString());
            String[] bracketStrs = arguments.toArray(new String[0]);
            List<BigDecimal> results = new ArrayList<>();
            for (String expr : bracketStrs) {
                System.out.println("替换前" + expr);
                Pattern pattern = Pattern.compile("([A-Z])(\\d+)");
                Matcher matcher = pattern.matcher(expr);
                StringBuffer sb = new StringBuffer();
                while (matcher.find()) {
                    String letter = matcher.group(1);
                    int index = Integer.parseInt(matcher.group(2)) - 1; // 将1-based转为0-based
                    if (index < bigDecimalList.size()) {
                        matcher.appendReplacement(sb, bigDecimalList.get(index).toString());
                    } else {
                        throw new RuntimeException("公式中的下标 " + index + " 超出范围");
                    }
                }
                matcher.appendTail(sb);
                System.out.println("替换后" + sb.toString());
 
                // 计算表达式
                ScriptEngine engine = new ScriptEngineManager().getEngineByName("JavaScript");
                try {
                    Object result = engine.eval(sb.toString());
                    results.add(new BigDecimal(result.toString()));
                } catch (Exception e) {
                    throw new IllegalArgumentException("无法计算公式: " + sb, e);
                }
            }
            // 根据函数名称进行相应计算
            BigDecimal finalResult;
            if (upperStr.equals("")||upperStr==null) {
                finalResult=results.get(0);
            }else {
                switch (upperStr) {
                    case "MAX":
                        finalResult = results.stream().max(BigDecimal::compareTo)
                                .orElseThrow(() -> new IllegalArgumentException("无法计算MAX值"));
                        break;
                    case "MIN":
                        finalResult = results.stream().min(BigDecimal::compareTo)
                                .orElseThrow(() -> new IllegalArgumentException("无法计算MIN值"));
                        break;
                    case "SUM":
                        finalResult = results.stream().reduce(BigDecimal.ZERO, BigDecimal::add);
                        break;
                    case "ABS":
                        finalResult = results.stream().map(BigDecimal::abs).reduce(BigDecimal.ZERO, BigDecimal::add);
                        break;
                    case "AVERAGE":
                        finalResult = results.stream().reduce(BigDecimal.ZERO, BigDecimal::divide)
                                .divide(BigDecimal.valueOf(results.size()), 2, BigDecimal.ROUND_HALF_UP);
                        break;
                    case "MEDIAN":
                        int size = results.size();
                        if (size % 2 == 1) {
                            finalResult = results.get(size / 2);
                        } else {
                            BigDecimal sum = results.get(size / 2 - 1).add(results.get(size / 2));
                            finalResult = sum.divide(BigDecimal.valueOf(2), 2, BigDecimal.ROUND_HALF_UP);
                        }
                        break;
                    default:
                        throw new UnsupportedOperationException("暂不支持函数: " + upperStr);
                }
            }
            System.out.println(results);
            System.out.println("计算结果: " + finalResult);
 
            return finalResult.toString();
            // 否则:没有公式代表不需要计算,直接提取List里面的数据
        } else {
            // 这里只会取列表第一个数据
            if (list.size() > 1) {
                throw new ErrorException("未给:" + insProductItem + " 配置公式,可是却采集到了" + list.size() + "个值!分别为:" + list);
            } else {
                return list.get(0).toString();
            }
        }
    }
 
    /**
     * 解析String数据
     *
     * @param data       采集到的文件字符串
     * @param dataConfig 用户配置好的x,y轴定位数据与参照物
     * @return
     */
    private static Map<String, String> analysisTxt(String data, Map<String, List<DataConfig>> dataConfig) {
        Map<String, String> map = new HashMap<>();
        dataConfig.forEach((k, v) -> {
            List<Object> list = analyzeData(data, v, k, ",");
            // 进行公式计算
            String resultValue = calculationFormula(list, v.get(0), k);
            map.put(k, resultValue);
        });
        return map;
    }
 
    /**
     * @param data       采集到的文件字符串
     * @param dataConfig 用户配置好的x,y轴定位数据与参照物
     * @return
     */
    private static Map<String, String> analysisString(String data, Map<String, List<DataConfig>> dataConfig) {
        String processingDataAfterSpaces = data
                .replaceAll("  +", splitIdentifier)
                .replaceAll("\r", "")
                .replaceAll(" ", "");
        Map<String, String> map = new HashMap<>();
        dataConfig.forEach((k, v) -> {
            List<Object> list = analyzeData(processingDataAfterSpaces, v, k, splitIdentifier);
            // 进行公式计算
            String resultValue = calculationFormula(list, v.get(0), k);
            map.put(k, resultValue);
        });
        return map;
    }
 
    /**
     * 取X,Y两个定位
     *
     * @param data       采集到的文件字符串
     * @param dataConfig 用户配置好的x,y轴定位数据与参照物
     * @return
     */
    public static Map<String, String> analysisList(String data, Map<String, List<DataConfig>> dataConfig) {
        Map<String, String> map = new HashMap<>();
        dataConfig.forEach((k, v) -> {
            // 用户可能给一个子项目配置了多个配置,即一个项目取多个值,所以需要循环
            List<Object> list = analyzeData(data, v, k, splitIdentifier);
            // 进行公式计算
            String resultValue = calculationFormula(list, v.get(0), k);
            map.put(k, resultValue);
        });
        return map;
    }
 
    // 由于在方法中会大量的判断,所以做一个方法
    private static int getXOrY(String value, String k, String tips) {
        try {
            return Integer.parseInt(value);
        } catch (NumberFormatException e) {
            throw new ErrorException(k + ":未配置" + tips + "坐标轴的值!");
        }
    }
 
    // 防止参照物为空报错,进行判断如果为空赋值空字符
    private static String getRefer(String refer) {
        return ObjectUtils.isNotEmpty(refer) ? refer.replaceAll(" ", "") : "";
    }
 
    public static List<Object> analyzeData(String data, List<DataConfig> v, String k, String split) {
        List<Object> list = new ArrayList<>();
        for (int config = 0; config < v.size(); config++) {
            // 取两个用户配置的参照物
            String referx = getRefer(v.get(config).getReferx());
            String refery = getRefer(v.get(config).getRefery());
            // 最终结果
            String result = null;
            // 通过\n将字符串分割为行
            String[] aColumnY = data.replaceAll(" ", "").split("\n");
            Integer end = null;
            // 采集数据:Y轴
            for (int i = 0; i < aColumnY.length; i++) {
                // 取x的值,防止报错
                int x = getXOrY(v.get(config).getX(), k, "X");
                // 如果Y与X用户都配置了则执行
                if (ObjectUtils.isNotEmpty(refery)) {
                    // 取Y坐标值
                    int y = getXOrY(v.get(config).getY(), k, "Y");
                    // 缓存Y的结束值
                    if (ObjectUtils.isEmpty(end) && aColumnY[i].contains(refery)) {
                        end = i + y;
                    }
                    // 判断是否在参照物为起到,Y坐标值为最终范围
                    if (ObjectUtils.isNotEmpty(end) && i <= end) {
                        String[] aLineX = aColumnY[i].split(split);
                        for (int j = 0; j < aLineX.length; j++) {
                            if (aLineX[j].contains(referx)) {
                                try {
                                    result = aLineX[j + x];
                                } catch (Exception e) {
                                    throw new ErrorException(k + ":X轴定位超出!");
                                }
                                break;
                            }
                        }
                    }
                    // 如果只配置了X,则执行下面的代码
                } else if (aColumnY[i].contains(referx) && ObjectUtils.isEmpty(refery)) {
                    String[] aLineX = aColumnY[i].split(split);
                    for (int j = 0; j < aLineX.length; j++) {
                        if (aLineX[j].contains(referx)) {
                            try {
                                result = aLineX[j + x];
                            } catch (Exception e) {
                                throw new ErrorException(k + ":X轴定位超出!");
                            }
                        }
                    }
                }
            }
            // 防止计算公式的时候出现:[null] 这种数据
            if (ObjectUtils.isNotEmpty(result)) {
                String formatProcessing = getFormatProcessing(result);
                list.add(formatProcessing);
            }
        }
        return list;
    }
 
    public static String getFormatProcessing(String value) {
        value = value.replaceAll("%", "");
        if (value.contains("=")) {
            String[] split = value.split("=");
            return split[split.length - 1];
        } else if (value.contains(":")) {
            String[] split = value.split(":");
            return split[split.length - 1];
        } else {
            return value;
        }
    }
 
    public static String getIp(HttpServletRequest request) {
        String ipAddress = request.getRemoteAddr();
        // 防止回环地址变为IPv6
        return ipAddress.equals("0:0:0:0:0:0:0:1") ? "127.0.0.1" : ipAddress;
    }
}